氣相色譜儀應用較為廣泛，理論上講可以分析任何可揮發性樣品，如在食品，水體，土壤等樣品中農藥殘留檢測，大氣有機污染物檢測，以及醫藥研發過程中所使用到的溶劑殘留檢測等。但在實際的應用過程中由于色譜柱耐受溫度的限制，其可分析的樣品的氣化溫度范圍受到了一定的限制。此外，與配備通用型DAD或PDA檢測器的HPLC相比，氣相色譜的檢測器一般配置通用型的氫火焰離子檢測器(FID)，該檢測器對于絕大多數有機化合物均具有響應，而不受化合物本身結構特性的限制(DAD或PDA檢測器受限與化合物本身具有紫外吸收特性)，且其響應的大小與分子結構中碳元素的相對豐度有關。
一般來講，氣相色譜儀一般由載氣以及載氣控制系統，進樣系統，色譜柱以及柱溫箱，檢測器以及數據采集與記錄系統組成。以下內容針對氣相色譜儀的進樣系統組成，進樣方式以及一些常見的問題，做簡單介紹。
氣相色譜儀的襯管多為玻璃或石英材料制成，主要分成分流襯管、不分流襯管、填充柱玻璃襯管三種類型。襯管能起到保護色譜柱的作用，在分流/不分流進樣時，不揮發的樣品組分會滯留在襯管中而不進入色譜柱。如果這些污染物在襯管內積存一定量后，就會對分析產生直接影響。比如，它會吸附極性樣品組分而造成峰拖尾，甚至峰分裂，還會出現“鬼峰”，因此一定要保持襯管干凈，注意及時清洗和更換。
氣相色譜儀玻璃襯管清洗的原則和方法
氣相色譜儀當以下現象：（1）出現“鬼峰”；（2）保留時間和峰面積重現性差出現時，應考慮對襯管進行清洗。清洗的方法和步驟如下：（1）拆下玻璃襯管；（2）取出石英玻璃棉；（3）用浸過溶劑（比如丙酮）的紗布清洗襯管內壁。玻璃襯管更換時要注意玻璃棉的裝填：裝填量3～6mg，高度5～10mm。要求填充均勻、平整。

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